参考来源生信常用数据格式: FASTA 格式 [https://zhuanlan.zhihu.com/p/3419...[作者空间]
本文主要工作:对SBT基因家族的基因结构进行可视化呈现 4.2 基因结构可视化 可视化基因结构,无非就是展示基因区...[作者空间]
前言做生信的小朋友看到别人文章里面的多序列比对图是不是感觉特别好看,特别养眼,但是让自己去做,出的图真是惨不忍睹,...[作者空间]
Cytoscape是我们日常数据分析中最常用的网络图绘制神器。今天小编给大家推荐一款2D转3D插件 -- cy3d...[作者空间]
MCscanX 软件用来做植物基因的共线性分析, 也可以做复制基因的分类分析,查看基因家族成员是否由 segmen...[作者空间]
存储基因和转录本的结构信息,gtf和gff3两种格式都可以。在实际分析时,会需要转换两种格式。比如,NCBI 只提...[作者空间]
转录因子分析的流程 一、从转录因子数据库下载大麦转录因子CDS序列 PlantTFDB - Plant Trans...[作者空间]
基因家族的概念 基因家族 : 来源于同一个祖先,由一个基因通过基因复制而产生的两个或多个拷贝而构成的一组基因,他们...[作者空间]
1.什么是蛋白互作? 在转录调控相关的文献中,我们经常能够看到这样的蛋白质相互作用网络(proteinprotei...[作者空间]
随着CFVisual的发表,作者前段时间抽了两天时间又将CFVisual做了一次升级。一直想写个推文,但是没有时间...[作者空间]
前言 康奈尔大学,FeiLab的一个预测工具。 iTAK 是依赖于数据库的用于从蛋白质或核苷酸序列中识别植物转录因...[作者空间]
本节概览:1. Cytoscape 软件基本介绍2. 数据导入:蛋白互作节点信息导入、其他注释信息的导入3. PP...[作者空间]
本节概览:1.STRING数据库基本介绍2.STRING R语言版——STRINGdb的使用:STRINGdb数据...[作者空间]
官网:http://www.hyphy.org/[http://www.hyphy.org/]http://www...[作者空间]
2021年8月2日,JGG在线发表了题为“EVenn: Easy to create repeatable and...[作者空间]
全网最全 GO 注释结果绘图,直击 SCI 绘图标注,关注我,您最好的选择! 前言 1. GO 原理 基因组测序已...[作者空间]
不同于动物可以主动逃跑躲避危害,植物无时无刻不与周遭的病原物作斗争。在长期的进化历程中,植物细胞膜拥有了patte...[作者空间]
https://mp.weixin.qq.com/s/bCkZ4L9IJTJTFUWKJMsuFw 来自联川生物 ...[作者空间]
一、 软件安装: 下载软件包https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executab...[作者空间]
网络上关于构建进化树的教程非常多,这里只挑重点部分讲解。 常见算法:Neighbor-Joining、Maximu...[作者空间]