原文链接:Tian D, Zhang R, Zhang Y, Zhu X, Ma J. MOCHI enables...[作者空间]
Raw contact to .hic → juicer_tools 软件地址:https://github.c...[作者空间]
参考:1.Package ‘RCircos’[https://cran.r-project.org/web/pac...[作者空间]
最近我要下200个ChIP-seq的数据,在下载的过程中发现,有的数据下载非常的慢!就像下面这种,我排除了大型机网...[作者空间]
Arrowhead(https://github.com/aidenlab/juicer/wiki/Arrowhe...[作者空间]
我们知道.hic 文件是高度压缩的二进制文件,便于存储和分析。那么如果我们想要从.hic提取某一区域的交互信息的话...[作者空间]
Juicer Tools 简介以及前期处理 Juicer 软件分析流程以及几大模块,如下图所示: JUICER主要...[作者空间]
实例:如何拿到KEGG数据库中多巴胺通路相关的基因集 一、确定目标通路 打开KEGG选择pathway,在搜索框前...[作者空间]
最近纽约复工,因为每天要做实验(还得全程戴口罩,非常闷得慌),比不了之前每天都在家可以为所欲为的自学生信,所以更新...[作者空间]
ABcompartment和TAD主要采用cworld 软件进行分析。 Cworld 软件架构如下: Cworld...[作者空间]
说到三维基因组可视化,就不得不说一下washU(http://epigenomegateway.wustl.edu...[作者空间]
Job dekker曾说 一切皆没有意义,除了在三维结构的前提下。那么对于三维基因组学多组学联合分析而言,我们也有...[作者空间]
ggsci是ggplot的主题包,它提供一系列高质量的调色板,其灵感来自于科学期刊、数据可视化库、科幻电影和电视节...[作者空间]
前言 PyMOL是一款由Python语言开发的开源的分子三维结构显示软件,被广泛运用于科学研究与教育领域,现由Sc...[作者空间]
1.kegg数据库下载 通常我们如果已知某个基因,想对这个基因做通路很简单,直接用kegg的网页注释就可以;如果想...[作者空间]