今天找计算测序覆盖度的时候发现了这个工具,github 主页是https://github.com/bioconv...[作者空间]
本文将逐步增加各种方法,有时间再研究各个方法的区别。每个人在转换id格式时,可能会遇到很多与以下流程不同的情况。比...[作者空间]
前几期小编给大家介绍了如何做一个组间网络分析图(Network Analysis)有小伙伴希望小编更新一期组内互作...[作者空间]
计算gc含量 计算序列长度 ggpairs更改配色 这个只是一种方案,还有好多问题没有解决,比如如何给下三角和上三...[作者空间]
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改软件可快速去除PCR重复,较samtools,picard更快 安装 点击下载后,减压缩即可http://lom...[作者空间]
在处理大批量的常见的fastq,fasta数据时,我们常常会使用一些自己写的一些python或者perl的scri...[作者空间]
maftools是对WGS和WES数据进行上游分析之后,进行somatic mutation分析的一个非常好用的包...[作者空间]
没空改了,等有空了再来修改格式吧############genomicranges的学习#############...[作者空间]
1. gatk best practice 2. four steps of HaplotypeCaller 2....[作者空间]
bedtools "merge" 许多基因组特征的数据集具有许多彼此重叠的个体特征(例如来自ChiP seq实验的...[作者空间]
最近要处理一些基因注释的文件,要用到bedtools这款经典的软件,在慢慢接触到这款软件才发现其功能的强大之处,在...[作者空间]
vcftools是一种可以对VCF文件和BCF文件进行格式转换及过滤的工具,其中很多过滤及计算功能我们可以自己使用...[作者空间]
当你构建完系统进化树,你当然是想让他变得美美哒,最后是能达到发CNS的level。 下面简单给大家介绍两个比较好用...[作者空间]
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本文是# GATK4全基因组数据分析最佳实践,我以这篇文章为标志,终结当前WGS系列数据分析的流程主体问题 | 完...[作者空间]
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