最近看了一个文章,里面有一段概述了WGCNA,分享给大家,希望对大家有所帮助 原文:Das S , Meher P...[作者空间]
老板最近在群里发了这篇文章,大致扫了下,发现这篇文章梳理了10多年来RNA测序相关的知识,几乎涵盖了市面上所有RN...[作者空间]
实验设计 实验目的决定试验方法和途径。试验目的 :获取三阴性乳腺癌的正常组织和癌症组织的基因表达差异情况,比较三阴...[作者空间]
UCSC的分析入口 打开UCSC Xena网站:UCSC Xena。(网页速度可能不太稳定)点击界面的GET ST...[作者空间]
从开始学习转录组分析,都是按照网上的教程别人的数据一步一步的跑,只要是严格按照教程上来,基本都不会出现错误。在...[作者空间]
持续更新ing.....最后更新时间:2019/3/8 10:28 AM 1.linux命令 1.1 linux...[作者空间]
刘小泽写于19.2.9转录本定量一般有两种方式,一个是基于比对定量(如RSEM、eXpress);另一种是不基于比...[作者空间]
1. 转录组数据统计推断的难题 在RNA-seq中进行两组间的差异分析是最正常不过的了。 我们在其它实验中同样会遇...[作者空间]
欢迎关注公众号:oddxixMoleculo原来是美国的一家创业公司。这家公司开发了一种拼接长测序序列的方法。这个...[作者空间]
一:前言 在生信的分析学习过程中,对结果的可视化是非常重要的,在很多生信文章常见的就是热图,PCA等图。但是在画图...[作者空间]
陈魏学基因系列视频- 单细胞RNAseq测序原理2 笔记 该方法的优势是:利用转录实现cDNA的扩增(每一轮转录可...[作者空间]
陈魏学基因系列-单细胞RNAseq测序原理 视频 总结 该方法有两个特点:特殊的引物设计,采用MMLV作为逆转录酶...[作者空间]
本文回答以下两个问题:1. 根据扫描得到的光点图,如何判断一个位置上的碱基是什么2. 评估1中判断的可靠性 插图全...[作者空间]
ilumina公司的二代测序使用的是边合成边测序和四色荧光可逆终止反应的方法。 四色荧光可逆终止反应中3’bloc...[作者空间]
外显子(exon expressed region)是真核生物基因的一部分,它在剪接(Splicing)后仍会被保...[作者空间]
RNA-Seq数据标准化方法 oriRNA在RNA-Seq的分析中,我们常用RPKM、FPKM和TPM作为转录组数...[作者空间]
STAR 软件由于其敏感的比对特性,因此在转录组 SNP Calling 过程中使用较多。 1. 下载安装 对于 ...[作者空间]
上周,我们分享了用RPKM值计算差异基因的方法,这周我们继续分享另外一种方法p-value。 我们都知道,在利用R...[作者空间]
1.转录组2.高通量测序3.转录组数据分析4.差异表达基因分析5.趋势性上调和下调基因分析6.基因集功能富集分析....[作者空间]
显著检验与多重检验校正的,分享给大家。周老师举例一直都是很生动的呢: 说到显著检验,还可以从东西方文化的差异谈起。...[作者空间]