我们在设计完引物之后，可以得到很多的候选引物。这个时候可以通过查看引物的质量来进一步的选择哪个引物更好一些。MFEprimer是一个可以用来评估引物质量的数据库。
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输入
MFEprimer数据库可以输入多个引物来评价各个不同组合之间的的质量。
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我们可以选择不同的基因组来对对引物进行blast评价。同时也可以通过设置Tm/Size等了设置引物设计的范围。
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输出
结果主要包括:
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A, 引物评价结果的的保存地址，这个结果会保存10天
B, 我们可以在这里查看每个引物的详细信息，同时点击J按钮。我们可以查看这个引物的的Tm值。
E，F可以查看引物是否存在Hairpin以及Dimer
G，可以查看引物潜在的扩增长度。
除了上述的基本信息，我们可以继续查看，
A，推荐的引物组合。
B，C，通过点击下面的可视化，可以查看这个组合引物具体的扩增结果。(figure 3, figure 4)
E, 另外还可以得到具体扩增的序列。
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代码行
另外关于引物质量评价。这个文章也提供了代码行来进行批量评价。下载网址: linux; mac
## Step 1: Index file
./mfeprimer-index -i genome.fa
./mfeprimer-snp-format -in snp.bed -out snp.json
## Step 2: Running MFEprimer
./mfeprimer -in test.fa -db genome.fa -out out.txt -dbSNP snp.json -bind -json
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