RNA-seq能测到rRNA序列吗？

作者: 佳名 | 来源:发表于2021-03-19 10:51 被阅读0次

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编码rRNA的基因属于中度重复序列，在基因组上有多个拷贝。
人的5.8s，18s，28s都由RNA45S编码，转录后剪切为5.8s，18s，28s
在基因组上总共又5个RNA45S，分别为RNA45SN1，RNA45SN2，RNA45SN3，RNA45SN4和RNA45SN5。分别位于13，14，15，21，22号染色体上。
理论上，RNA-seq有去除rRNA的过程，虽然能测到，但是应该丰度较低。

RNA28SN1.PNG

RNA18SN1.PNG

RNA5-8SN1.PNG
从RNA-seq结果来看：表达量:28s:18s:5.8s=180:10:1
既然是同一个基因转录的，为什么表达量差别这么大呢？

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