转录组研究中上下调DEGs的输出
原创: 星空321 青年卓越 9月17日
转录组
随着高通量测序技术的发展,组学研究如雨后春笋,而转录组更是应用最多,最常规的基因表达差异研究的手段,转录组(transcriptome)广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA及非编码RNA;狭义上指所有mRNA的集合。RNA-seq一般用来探究不同时期或环境下器官、组织或单细胞的基因表达差异。而公司的测序数据是不能直接分析和可视化的,DEGs的探究是我们处理转录组数据的最终目的,本次小编就转录组怎样得到DEGs的R脚本进行分析。
代码分享
以上就是本期推文的所有内容,代码均为小编一个一个敲出来的,当然小编第一步导入的数据是在服务器上经过比对,文件格式转换等步骤拿到的,具体如何处理,等小编下回分解。有疑问或需要源代码请给小编留言,记得下方点赞哦!
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主编:天马星空
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