很多时候，我们拿到一个物种的一堆基因ID，比如关联分析出来的？或者是差异表达分析出来的。我们会开始想，这些基因的功能是什么，或者直接一点，这些基因的同源基因在另一个物种是哪个？是否表达模式有趣？是否已经有相对明确的功能。或者，更为常见的：比如我做荔枝的，那么我会想看到，手上一堆荔枝的基因，都是拟南芥上的哪些基因的同源基因？更或者是甜橙上哪些？
于是，我们最经常做的，就是把当前物种的基因ID映射到另一个物种的基因ID上。
正好朋友在做这块工作遇到了一点小问题，干脆，我就拆解出去年写的一段代码，做成一个新的TBtools功能。
界面如下：
*.IDconverted.Result.xls文件。打开即为映射结果。
这个功能，感觉没什么用但是又觉得似乎有用。希望对大伙有帮助或许。
准备工作 这里进行包的导入 基因ID类型的转换 bitr转换 参数： x：基因ID向量 fromType：目前基因...
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尚未进行基因组测序的物种，在进行基因组测序前，首先需对该物种进行 genome survey。一般通过两个途径：细...
关于TCGA基因ID转换的一些问题。 之前id转换是用的R包org.Hs.eg.db进行转换的，后面因为其收录的E...
#BiocManager::install("clusterProfiler") #BiocManager::in...
gene symbol 与 entrezid 转换
一、ENTREZID转换 进行功能注释，首先需要对差异基因deg数据集进行ENTREZID转换 二、输入数据准备 ...
Bioconductor开发的物种注释包系列集合了一个物种不同来源的注释信息，能够根据基因ID对其进行多种来源的注...
Bioconductor开发的物种注释包系列集合了一个物种不同来源的注释信息，能够根据基因ID对其进行多种来源的注...
本文标题：小功能 | 快速准确地进行两个物种的基因ID转换
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/apmdedtx.html
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