1.fastq 转fasta文件：
awk '{if(NR%4 == 1){print ">" substr($0, 2)}}{if(NR%4 == 2){print}}' xx.fastq >xx.fasta
2.对压缩的fq.gz计数：
zcat *fq.gz | wc -l
1.fastq 转fasta文件：
awk '{if(NR%4 == 1){print ">" substr($0, 2)}}{if(NR%4 == 2){print}}' xx.fastq >xx.fasta
2.对压缩的fq.gz计数：
zcat *fq.gz | wc -l
本文标题：fasta文处理
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/avftgltx.html
网友评论