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两个物种及多个物种共线性分析——TBtools

两个物种及多个物种共线性分析——TBtools

作者: 墨白的生信学习笔记 | 来源:发表于2022-07-17 19:15 被阅读0次

———— 奋斗没有终点,任何时候都是起点(来源于网络)

物种间共线性文件,只需要用TBtools就可以完美解决

1.下载好物种的基因组文件与gff注释文件

打开One Step MCscanX,但是这个很慢,于是去Plugin Store下载了超快插件,果然名副其实,10min就输出了!

输出结果

先做两个物种的共线性

将结果中的三个文件以及整理好的高亮基因放入

出图

2.继续做三个的,放入基因组文件与gff注释文件

将所得结果的这三个文件,分别合并

将合并结果放入,高亮的基因整理好,放入

出图

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