参考此网站改善的:https://www.jianshu.com/p/a23d6f1226a1
## 这个比较简单好用。
## 第一步
cd /datapool/gesong/mengqinglin/sh/
bgzip -c 你的.vcf > 你的.vcf.gz
tabix -p vcf 你的.vcf.gz
##第二步
cat 你的参考基因组.fasta \
| bcftools consensus \
你的.vcf.gz > 你的.fa
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## 这个比较简单好用。
## 第一步
cd /datapool/gesong/mengqinglin/sh/
bgzip -c 你的.vcf > 你的.vcf.gz
tabix -p vcf 你的.vcf.gz
##第二步
cat 你的参考基因组.fasta \
| bcftools consensus \
你的.vcf.gz > 你的.fa
本文标题:vcf格式转fasta格式
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