上一章我们得到了 .hic文件，从上图我们清楚的看出可以利用 juicer tools 对.hic 文件进行feature annotation 和 analysis 或者 data extration。也可以利用 juicebox 进行可视化。可视化文件主要使用的是 .hic 文件和各种 feature annotation 文件，例如 Contact domains 和 Loops 等。
https://github.com/aidenlab/juicer/wiki/Pre#file-format
pre 命令允许我们从自己的数据转换成 .hic 文件，暂时没有需求先不写。
https://github.com/aidenlab/Juicebox/wiki/Download
https://github.com/aidenlab/Juicebox/wiki
还有油管视频
写在前面 上一章我们得到了 .hic文件，从上图我们清楚的看出可以利用 juicer tools 对.hic 文件...
参考： [1]. Durand, N.C., et al., Juicer Provides a One-C...
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本文标题：Juicer:Hi-C数据处理分析（二）
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/btlchctx.html
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