100天生信-Day9

所有高通量测序的下机数据一般都要进行质控，检测数据质量，并去除低质量reads。
之前比较常用的是fastQC质控 + cutadapt去接头 + Trimmomatic；
今天使用一款非常简单的软件：fastp，优点是极为简单，又可以使用多线程，特别快速。

## i/I 和 o/O参数分别代表双端数据的输入和输出；
## -w 参数代表使用线程
fastp -i Ta_Input_1.fq.gz -I Ta_Input_2.fq.gz 
\ -o Ta_Input_1_filter.fq.gz -O Ta_Input_2_filter.fq.gz 
\ -w 4 
\ > fastp_input.log 2>&1 &

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2019-02-19
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