R plot / ggplot2加透明度

有的时候在画图的时候，需要调节一下点或者bar的透明度，看起来更好看一点。

1. ggplot2 - alpha参数

library(ggplot2)
data(iris)
ggplot(iris, aes(x = Sepal.Length, y = Petal.Length, color = Species)) + 
geom_point(size = 3) + theme_bw()

画出来：

scatterplot without alpha

加上透明度，alpha范围是从0到1，1是原来的颜色，数字越大颜色越深。

ggplot(iris, aes(x = Sepal.Length, y = Petal.Length, color = Species)) + 
  geom_point(size = 3, alpha = 0.3) + theme_bw()

效果：

scatter plot with alpha

2. plot修改
   plot画图的时候，直接修改col就可以，一个比较方便的方法是用rgb()函数。这个函数提供三个值，默认情况下是0到1的值，可以修改maxColorValue为255，这是我们比较常见的数值范围。rgb还可以提供第四个参数，也就是透明度。如下所示：
   没有透明度：

plot(x = iris$Sepal.Length, iris$Petal.Length,  
     pch = 18, cex = 2, col = rgb(45, 67,121, maxColorValue = 255))

plot1

修改透明度：

plot(x = iris$Sepal.Length, iris$Petal.Length,  
     pch = 18, cex = 2, col = rgb(45, 67,121, 100, maxColorValue = 255))

plot2