在进行测序之前，需要制备测序文库，这其中就涉及到了一些名词，了解这些名词对于后面的数据分析还是有帮助的，下面我就列出我知道的一些
index，adapter，barcode，tile，flowcell，lane，full Y-adapter
此外，还应该知道adapter是如何加上去的，以及如何起作用的
我的理解：简单来说就是提取基因组DNA后，用超声波打断或酶切打断，然后跑胶得到300-500bp的小片段，因为打断是随机打断的，可能有粘性末端，所以用酶来形成平末端，再在平末端后面加上A碱基得到粘性末端，在加上adapter，加到flowcell上，进行几轮的PCR扩增，就得到了测序文库（当然，这其中还包括了很多的反应和步骤）。adapter包括了三部分依次是与flowcell上结合的oligo，区分样品的index，测序需要的引物premer
在测序时，首先是测序引物和序列结合，然后进行边合成边测序（连上一个碱基，测一次，然后进行化学反应，再连碱基，再测序，这样循环下去），测够长度后，将合成的序列去掉，然后加上另外一个premer来测index，这样每个reads都有一个index（用来识别样品来源），然后在进行一次桥式PCR扩增，去掉已经测过序的那条链，再进行一次测序。
有一点需要注意的是，当插入的序列（也就是超声波打断的小片段）如果比较短的话，就可能测到premer和index，当然这种情况比较少见，所以得到数据后，要进行去cutadapter。
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