对中医稍微有些了解的爱好者都知道，中医中有一个子午流注理论，主要是指一天中十二时辰气血在不同的经络活跃。根据这个理论，中医针灸有按时进行针灸的子午流注针法，而武术中也发展出按时辰进行点穴截脉的截血法。对于很多人来说，只是了解子午流注的时间和经络对应就可以，然而对于修行人而言，子午流注却蕴含着修行中的奥秘，不能不深究其中的深意。
为什么人类会产生子午流注现象，从天人感应来说，这是因为地球吸收与放射太阳能量造成的。地球吸收和释放太阳能量时，人体会产生相应的激素和蛋白质等物质来调节人体气血网络的运行速率和频率，这就是子午流注。
常识中的阴阳颠倒根据常识很多人会说，早上太阳出来（卯时5-7点）地球开始吸收太阳能，晚上太阳落下（酉时17-19点）地球开始放射太阳能。然而子午流注却以子时和午时作为转换的基准，所谓子时一阳生，此时温度却持续降低，午时一阴生，温度却持续升高，很多人对这种常识中的阴阳颠倒都不能理解，而这正是子午流注奥秘的关键。
复归其根——阴阳的真实意义其实此时所谓的一阳生，并不是指地表放热会导致温度升高的浮阳，而是地表内部地心的放热能力，从太阳落山的时候一直到晚上十一点，地心其实还在吸收地表散发的热量，所以这时候并不是单纯的放热，从子时开始，地心才开始真正的放热，这才是纯粹的阳，真阳的能量。一阴生的道理也一样，也不是指地表吸热导致温度降低的浮阴，其实从日出到中午十一点的时间里，地心还在放热（地表也在吸收地心的放热），只有到地心完全放出热量开始吸收时，才是真阴产生。浮阴浮阳和真阴真阳，这正是修行的关键，浮阴浮阳就像是地表的温度变化，冷空气、湿度、云层等都会对地表的温度造成剧烈影响，而真阴真阳就像地心的温度变化，稳定而平稳地维持着循环。只有稳定而持续不容易受外界干扰的气血循环，才能称得上修行，这就是道德经所说"夫物芸芸,各复归其根.归根曰静,静曰复命"。
子午流注的修行意义子时一阳生，是地心开始放热的时候，在天人感应中，也是人体的真阳产生的时间，体表的阳气干扰降低，内中阴极转阳，才能感应到深层的气血的运作，这是归根的过程。而子时胆经活跃，人体处于排出毒素积蓄中气的最佳时段，此时可以按摩章门期门黄庭，引导肝胆排出浊气，补益中气。午时一阴生，是地心开始吸热的时候，在天人感应中，则是人体真阴生时，体表阴气的干扰干扰降低，内中阳极转阴。而午时心经活跃，人体处于滋养心血降心火强神志的阶段，此时可以按摩内关、少海、目内眦、黄庭、肾腧，引导小肠消化营养入心血并降心火与肾气相合。
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