aspera批量下载

preftech比较慢,而且下载后还要解压，所以使用aspera快速下载一波

因为ENA跟NCBI的SRA数据是互通的，所以根据NCBI的SRP号就可以在ENA搜到相应的数据。目前好像无法由于存储位置的改变，无法直接用ASCP下载SRA数据库，因此直接从ENA数据库下载便是一个非常好的选择。
ENA Browser

安装aspera

mamba install -y  -c hcc aspera-cli

ENA Browser标准下载流程教程

单个样本

ascp -QT -l 300m -P 33001 -i path/to/aspera/installation/etc/asperaweb_id_dsa.openssh \
era-fasp@fasp.sra.ebi.ac.uk:vol1/fastq/ERR164/ERR164407/ERR164407.fastq.gz \
local/target/directory

多个样本，

比如PRJNA713302这个项目里面有多个样本，只要下载批量ID
从ENA数据库下载

cat fq.txt |while read id
do
ascp -QT -l 300m -P33001  \
-i ~/miniconda3/envs/download/etc/asperaweb_id_dsa.openssh   \
era-fasp@$id  .
done

PRJNA713302这个10x单细胞fastq实战 (qq.com)