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SRA数据库-二代测序fastaQ数据的下载

SRA数据库-二代测序fastaQ数据的下载

作者: 小陈生信日记 | 来源:发表于2023-05-03 15:08 被阅读0次

    SRA数据库介绍

    SRA(Sequence Read Archive)数据库是NCBI旗下用于存储高通量测序数据的子库,SRA数据库收集着测序的原始数据,可以免费下载全球已发表文章的原始测序数据。SRA数据库的基本框架是基于 STUDY, SAMPLE, EXPERIMENT, RUN 四个概念构建的。

    STUDY :研究课题/研究项目,前缀 SRP,DRP,ERP 开头。

    SAMPLE :样本信息,前缀 SRS,DRS,ERS 开头。

    EXPERIMENT : 实验信息, 一次实验包含了一个或多个样本进行一个或多个RUN的测序。前缀 SRX,DRX,ERX 开头。

    RUN : RUN对应某一个/对fastq下机的文件。前缀 SRR,DRR,ERR 开头。

    注:前缀的第一个字母:表示样本原始被上传到的源数据库,NCBI数据库会同步EBI和DDBJ数据库的测序数据。

    NCBI SRA数据库

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    转录组24组数据

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