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Perl语言在生物信息学中的应用——学习笔记(1)

Perl语言在生物信息学中的应用——学习笔记(1)

作者: lxmic | 来源:发表于2018-03-18 21:50 被阅读315次
Coding

1. Perl学习起源

长话短说,本科开始已经有些意识到,需要编程语言来支持生物信息学的学习。我也不想被时代甩的太远,始终想要学习一本编程语言。
首次接触到Perl语言,还是本科导师提起的,他在学习perl语言,因为他本人也是一个希望不断学习,积极向前的人,所以我瞬间就觉得perl应该非常不错,于是那时在我心中播下了一颗编程的心,想要学习生物信息学的心。
正好,我所在实验室也从来是纯实验出生,没有任何生物信息学分析的能力,这就更加坚定了我要自学入门生物信息学,于是开始偷偷地学习。一开始相当艰辛,没有任何编程的基础,也没有类UNIX系统的使用惊艳,不会命令行进行操作,完全是一个小白。
就这样,我就开始了我的生物信息学之旅。一切都是因为本科所种下的种子,开始发芽。

2. 前言

这个时代,已经在处于高速发展的状态,应该难以很快停止下来,或者说永远也不会停下来,始终要在这趟列车上,不断改变自己的状态来适应列车速度的变化。如果始终一成不变,那么终将会被抛弃,无法存在。近年来,生物数据已经在飞速的增长,太多太多的信息我们无法进行获取,包含的生物信息,始终处于隐藏状态。面对如此大规模的数据,我们人工进行挖掘已经变得不可能,我们必须利用计算机来帮助我们进行运算进行数据挖掘。
生物信息学,本来就是生物科学和计算机科学的交叉学科。它应用计算机工具和技术来管理并分析生物学数据。面对大数据,编程非常有必要,能够大大地提高工作的效率。
本书是一个指南,指导生物学家如何去编程。每个科学研究人员,都要学习编程,具有一定的编程能力来分析处理生物数据。新时代有新时代的要求,我们绝不可能一成不变,要去改变。

3. 本书内容概要

共有12个章节,从浅入深,一步一步带领新手进入perl编程世界。这里我提供下载链接,有想学习的同学,可下载自行学习,我也会不定期(纯实验出生,只有很少很少的时间来写这些笔记,我会尽力每周一更)更新我的学习笔记,欢迎一起学习进步和交流。

除了在简书更新,我会在个人博客——Lxmic Blog 同步发布,欢迎大家。
中文版的Github网址:https://github.com/gaorongchao/Beginning-Perl-for-Bioinformatics/tree/master/Chapters
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