GXFsplit | 合理切分GFF/GTF文件~用于团队式物种

写在前面

昨天带娃一天，晚间21点回到办公室，顺手写了「GXFcat」，尽管实际功能是前天写的。昨晚主要是调试和打了一个界面。上午来到办公室，想起来一个事情，如果没有切分（split），那么为什么需要合并（cat）？于是，为了让「所有有想法进行全基因组基因结构注释校正」的朋友都能轻松合理切分 GFF/GTF 文件，为此，我还是决定写一个「GXFsplit」功能。
这个功能实现需要考虑的是两个问题：

1. 每一个基因是一个单元，不能按行甚至不能按某个基因来切分，因为可能会有重叠基因，尽管概率比较小在植物上；
2. 尽量让每个人都平均分配到等量基因数，主打一个公平。

GXFsplit

总而言之，我写了一个非常有趣的功能，「GXFsplit」。我甚至觉得有了或者功能，我们基本就可以切分文件，然后交给一堆学生去做某个物种的校正，然后最后再「GXFcat」，然后全面查看一下就完事了。

使用起来非常简单，就是：

1. 设置输入的待切分的 GFF3/GTF 文件
2. 设置输出文件路径前缀
3. 设置需要分割的文件数（注意到，有可能会多一个文件出来....完全平均比较麻烦，我就不写完全平均了）

大体操作如下：

运行后结果如下

然后就搞定了，可以分配出去开始校正了

简单查看分配准确和合理性

顺手统计了下，没啥问题，我还统计了其他....

写在最后

有一些事情，所有人都知道可以做，但是做了也不会有理想的回报。但这些事情，总要有人去做，一直放着，也不是办法。傻人有傻福。真正有趣的现象时常是青年发现，或许原因不在于能力，而在于“无知”。