RNA-seq分析全过程二（mac版）：下载SRA数据

作者: JACK_DAVID | 来源:发表于2021-03-17 09:23 被阅读0次

转录组（3）：了解fastq测序数据
RNA-seq实战分析流程
下载SRA数据（一）
Note1_批量化RNA-seq
SRA Toolkit
SRA-tools安装使用（Windows为例）
NGS小技能（2）：如何进行SRA到fastq格式的快速转换
SRA Toolkit的使用和安装
下载SRA数据（二）
SPSS for Mac v25 数据分析统计中文破解版下载

# 在终端运行

#用axel下载会快一些

brew install axel

for i in {56..62}

# 也可以用wget 下载

axel  https://sra-download.ncbi.nlm.nih.gov/traces/sra40/SRR/003505/SRR35899$i

done

NCBI-SRA数据下载的3种方法

https://www.omicsclass.com/article/964

转录组（3）：了解fastq测序数据
学习目标：前面下载了SRR3589956.sra-SRR3589962.sra的RNA-seq数据，本次用sra...
RNA-seq实战分析流程
一、下载测序数据 ①SRA数据库[存储二代测序的原始数据]②在进行上游分析时，数据格式转换过程概述如下：sra↓F...
下载SRA数据（一）
我们常常需要对别人文章中的转录组数据进行数据分析挖掘，这是就需要从NCBI下载SRA数据了。而从NCBI下载SRA...
Note1_批量化RNA-seq
建立索引拆分sra数据批量压缩文件 rna-seq流程
SRA Toolkit
一、简介： SRA Toolkit是将ncbi上 .sra文件（文献中的各种数据，如：Chip、Rna-seq等...
SRA-tools安装使用（Windows为例）
安装SRA-tools下载SRA数据下载SRA、GEO中的测序数据，可以使用prefetch，prefetch安...
NGS小技能（2）：如何进行SRA到fastq格式的快速转换
前言生物信息分析人员一般会接触到从NCBI等网站下载的SRA数据，之前也介绍了下载SRA数据的几种方式。下面，我...
SRA Toolkit的使用和安装
从NCBI上下载SRA原始数据，使用SRA TOOLKIT 进行下载和转化。 1. 下载SRA Toolkit （...
下载SRA数据（二）
上一篇图文中介绍了最简便实用（个人认为）的SRA下载方法。第二篇介绍在服务器上使用NCBI官方的下载软件下载SRA...
SPSS for Mac v25 数据分析统计中文破解版下载
SPSS for Mac v25 数据收集分析报告统计软件中文破解版下载下载地址：https://www.ma...