简介
免疫浸润的分析方法有很多,我在之前也已介绍过。像 Cibersoft有网页版也有R语言版,没有R语言基础要去学其实是需要学习成本的。这里介绍一个完全不需要找人帮忙的网页分析工具。
有什么功能?
可以使用的免疫浸润分析算法包括 :
• [TIMER] 算法
• [CIBERSORT, ]https://doi.org/10.1038/nmeth.3337)
• [quanTIseq, ] https://doi.org/10.1186/s13073-019-0638-6)
• [xCell ]https://doi.org/10.1186/s13059-017-1349-1
• [MCPCounter]https://doi.org/10.1186/s13059-016-1070-5)
• [EPIC]https://doi.org/10.7554/eLife.26476)
上图
比较不同算法计算出的免疫细胞浸润的差异
image.png计算各种算法计算出来的免疫浸润分数
image.png所有这些结果都包含excel表格数据,也就是你同时拥有了各种算法计算的能力。
我知道这样的工具分享出来以后,马上就会有人来抄袭,然后发布到其它公众号 。所以我选择用1RMB把这批人筛选出去。
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