报告老师！我想用「TBtools」在 Windows 上分析重测

写在前面

有些事情，说要做，就总要做的。
Emmm，过去的几年，开展高通量测序数据分析时，常常遇到的两个问题，已经有了一定的改变：

1. 本机硬件性能不行，现在基本都还行，主频或睿频 4.0GHz 的CPU比比皆是，更不提一下子就是 32 个线程，放在几年前，那么已经是一个工作站了；1TB 的 SSD 甚至不用 600 块钱，远低于常见的一个试剂盒....
2. 数据分析软件运行效率不高，且资源占用大，目前已有极大改变。

于是，在本机直接开展“不大量”的数据分析，成为可能。最简单的来说，那么就是「BSAseq数据分析」。我说过了，这个可以，那么就是可以，只是时间问题。
最近就慢慢一个一个释放出去，先从比对开始。

BWA-MEM2 GUI Wrapper

比对是一个比较复杂的事情，尤其是当我们把这个事情放到 Windows 上。
不过现在不会了，因为咱们有「TBtools」，把这些东西都准备好了，就等大家买个好的工作电脑....
一步一步来，今天第一步，做重测序数据比对到基因组。
使用新的插件功能，界面和使用如下

只要这样输入，然后过夜培养，基本就可以了。如果还不行，那就是测序数据量太大，比如 50Gb，那就再等等等等。正常完成后会看到

注：此处我只用单端比对了下，双端也是支持的，就如示例图片。

写在最后

简单来说，这一系列的功能，放出来，总是会被一些人嘲笑。因为在他们看来，这些没啥意义。很多人其实是「pipeline-runner」，他们沉浸在自己是「Bioinformatisian」的幻想世界，而同时看不上咱们的「搬砖」工作。他们以前不懂，现在不懂，以后还是不懂。
有时候，是对是错，时间会有答案，做了再说。