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Windows安装圈图软件circos

Windows安装圈图软件circos

作者: 华大基因学院 | 来源:发表于2021-11-10 10:50 被阅读0次

Circos是使用Perl语言编写,采用GPL许可,可以运行于任何有Perl语言解释器的操作系统的免费软件。Circos本身不进行数据处理,所以在Windows上安装,更方便编辑纯文本的配置文件,同时查看圈图输出的图片(PNG)或矢量图片(SVG)的再次调试。

软件下载:
Circos:http://www.circos.ca/
Perl的Windows安装包:https://strawberryperl.com/
Perl的依赖模块下载:https://www.cpan.org/

安装步骤:

1、下载Circos解压缩到指定路径。

2、Circos运行的前提是Perl解释器,所以需要在Windows上安装Perl到指定路径。

Perl安装完成后在cmd命令行测试能否正常运行。cd 切换到安装路径,输入perl -version能够正常出现版本号代表已经安装好。

3、下载Perl的依赖模块解压缩到Circos安装文件的lib文件夹下 。

4、Perl的模块全部要安装,保证运行时可以正常调用。cmd命令行中进行调用Perl进行如下安装:

perl makefile.PL
gmake
gmake test
gmake install

依次cd进入各个模块进行安装……如果模块中没有makefile.PL,而是build.PL,需要进行如下安装:

perl build.PL
build
build test
build install

5、测试Circos圈图各种样式能否正常绘制。

perl .\bin\circos -conf .\example\etc\circos.conf

安装成功!

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