1.wget 方法
ftp://ftp-trace.ncbi.nih.gov/sra/sra-instant/reads/ByRun/sra/SRR/SRR207/SRR2078288/SRR2078288.sra
修改后面三项
点击all runs 获取 SRR号
wget -c 修改后的连接
但是速度很慢，一条一条输入
参考： 手把手教你如何下载SRA数
centos 如何去掉锁屏功能CentOS取消屏幕保护自动锁屏功能 - Catherine的笔记 - CSDN博客
2. 如何批量下载
3.
ps -ef | grep prefe 查看后台prefe的命令
ps -ef | grep prefe | awk 'print $2'|while read id ; do kill $id;done
grep failed raw/nohup.out
zless -SN SRR.fastq.gz
ls *gz | xargs fastqc -t 10
multiqc ./ 合并fastqc
从NCBI上下载SRA原始数据，使用SRA TOOLKIT 进行下载和转化。 1. 下载SRA Toolkit （...
如何从NCBI下载SRA数据 我们通常需要从NCBI去下载公共数据，这些数据常常是以SRA格式存储在云端，那么我们...
我们常常需要对别人文章中的转录组数据进行数据分析挖掘，这是就需要从NCBI下载SRA数据了。而从NCBI下载SRA...
1.wget 方法 ftp://ftp-trace.ncbi.nih.gov/sra/sra-instant/re...
从ncbi下载数据，GEO-GEO号/SRA-SRA号/SRA-SRP号，找到最终的SRP号，在搜索界面send ...
因为我自己以前下载数据主要是从NCBI下载的SRA格式的数据，而SRA文件的解压主要是用sratools中的fas...
#从ncbi下载数据，GEO-GEO号/SRA-SRA号/SRA-SRP号，找到最终的SRP号， #在搜索界面se...
介绍 SRA Toolkit是下载NCBI SRA数据库文件的下载和转换为fastq的工具 SRA Toolkit...
2021/03/25 一、测序数据下载 NCBI SRA 数据库 【使用说明[https://trace.ncbi...
前言 生物信息分析人员一般会接触到从NCBI等网站下载的SRA数据，之前也介绍了下载SRA数据的几种方式。下面，我...
本文标题：2019-05-02从NCBI SRA下载数据
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/imfonqtx.html
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