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在NCBI上上传叶绿体基因组

在NCBI上上传叶绿体基因组

作者: 路人里的路人 | 来源:发表于2022-07-26 21:50 被阅读0次

                                                         

    Bankit(也可使用该项上传trnl-F序列)

    在使用Bankit上传叶绿体基因组时还需要准备一些前提文件:

    第一个:拼接好的叶绿体基因组文件(具体方法:)

    第二个:物种的fasta与TBL文件(具体方法:)

    打开NCBI官网,进入Bankit(官网:BankIt (nih.gov)),点击Start Bankit Submission,开始上传。

    共有八个步骤,具体操作如下:

    第一步contact,该步主要是确认上传者的信息,以前已经填写好了直接continue.

    第二步Reference,主要是填写自己的名字,填写后continue.

    第三步sequencing techoligy,填写内容如下图。

    图一

    第四步Nucleotide填写要求如下。若是叶绿体基因组则选择immediately after processiing,Trnl-f则可以指定释放日期,叶绿体的topology选circular,trnl-f选Linear,设置好后点continue.

    图二

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