TISIDB (an integrated repository portal for tumor-immune system interactions）是一个肿瘤免疫分析的数据库。首先，该数据库整合了肿瘤免疫学相关五大类数据资源 PubMed 数据库的文献挖掘结果；用于检测肿瘤细胞对 T 细胞介导的杀伤的耐药性和敏感性的高通量筛选数据（ CRISPR-Cas9、shRNA 和 RNAi等）；接受免疫治疗的患者队列的外显子组和 RNA 测序数据集； TCGA的 30 种癌症的基因组学、转录组学和临床数据；多个公共数据库注释信息（UniProt、GO、DrugBank 等）。其次，还将这五大类资源划分为了10个方向，分别是：功能（Function）、文献（Literature）、高通量筛选（Screening）、免疫疗法（Immunotherapy）、肿瘤浸润淋巴细胞（Lymphocyte）、免疫调节剂（Immunomodulator）、趋化因子（Chemokine）、亚型（Subtype）、临床（Clinical）及药物（Drug）
TISIDB-1
★ 网站主页设有快速搜索栏，支持输入的项目包括gene symbol、gene name、HGNC ID等。初始，设定以CD47为例子，点击"Submit"即可提交，在新的页面中，点击最前面的基因名即可确定并进入后续分析
1. 十大方向
1.1 
TISIDB-2
★ "Summary"里面展示了输入基因的基本信息，包括：基因名（缩写和全名）、别名、染色体位置、该基因的外部链接和本页面的主要内容(亚细胞定位、蛋白质结构域和功能以及GO和通路):
1）Subcellular Location, Domain and Function
依次展示了亚细胞定位、域和功能
2）Gene Ontology
包括了BP、MF和CC三个部分
3）KEGG and Reactome Pathway
包括了常用的KEGG和Reactome两种
1.2 
查阅报道搜索基因与抗肿瘤免疫（如浸润和T/NK细胞功能）关系的文献，主要包括：PMID号、肿瘤类型、免疫相关和原文中的重要描述
1.3 
筛选在各种高通量数据集中搜索的基因是否会导致耐药性或增加对 T 细胞介导的杀伤的敏感性（当前数据库中收集了九组筛选数据集）。结果包括：PMID号、筛选系统、肿瘤类型、细胞系、数据集、统计结果与免疫的相关性
1.4 
包括：
1）应答者与非应答者的表达差异
2）应答者与非应答者的变异差异
TISIDB-3
1.5 
TISIDB-4
★ 探索肿瘤浸润淋巴细胞 (TIL) 的丰度与当前基因的表达、拷贝数或甲基化之间的相关性。默认展示搜索基因的表达与肿瘤浸润淋巴细胞的相关性热图（鼠标悬停在热图的格子上会显示相应的X轴、Y轴信息及Value值）：
1）可在 "1" 处，选择"CNA(拷贝数变异)"、"met(甲基化)"、"mut(突变)"等
2）可在 "2" 处，选择具体的癌种和免疫细胞来展示具体的情况
1.6 
★ 免疫调节剂主要包括：免疫抑制剂、免疫刺激剂和MHC分子三类
1.7 
★ 趋化因子包括：趋化因子和受体两类
1.8 
TISIDB-5
★ 亚型包括：免疫亚型和分子亚型两类
1.9 
★ 临床包括：总生存分析、癌症分期和肿瘤分级三类
1.10 
TISIDB-6
★ 展示来自DrugBank数据库的靶向搜索基因的药物汇总
2. 浏览（Browse）数据库
TISIDB-7
★ 包括Literature（文献）、High Throughout screening（高通量）、Cohorts with immunotherapy（免疫疗法）、Function（功能）4类：
1）按文献浏览：可查看与基因相关的文献数量
2）按高通量筛选浏览：可查看能说明基因对T细胞介导的杀伤具有抗性、敏感的数据集的数量
3）按免疫疗法浏览：展示基因在响应者和非响应者上调、下调的队列的数量（limma: logFC>1.5, P<0.05)；响应者、非响应者中基因发生显著突变的队列的数量（Fisher: P<0.05)
4）按功能浏览：免疫相关基因（即免疫抑制剂、免疫刺激剂、MHC、趋化因子和受体）
3. 搜索（Search）数据库
TISIDB-8
★ 包括Simple Search（简单搜索）、Batch Search（批量搜索）、Search the literature mining data（检索文献挖掘结果）3类：
1）简单搜索：可以根据基因符号、基因组ID等基本术语搜索一个基因
2）搜索一个基因列表
3）检索文献挖掘结果
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