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给你看,我用的就是这些包🧐

给你看,我用的就是这些包🧐

作者: 刘小泽 | 来源:发表于2020-04-19 15:04 被阅读0次

    刘小泽写于2020.4.19
    题目依然是花花帮忙起的
    今天来介绍一个简单又实用的需求,就是如何自动化给每个包添加对应的说明和版本信息

    前言

    我们首先来假设一个情境,而且一定会遇到:

    我自己有一个脚本,想发给别人用,但别人收到后却产生某个包的报错。于是第一步,他会问:你用的R包都是哪个版本啊?我怎么重复不出来?

    这时一般我们会用sessionInfo(),得到下面的全部配置

    但当我们安装的R包数量有点多时,别人可能要仔细从中寻找对应的包的版本

    那么问题来了:能不能一开始加载包的时候,就直接标注包的版本呢?

    一个善于观察的人写了一个有趣的包

    这个人叫:Luis Verde Arregoitia (https://github.com/luisDVA/annotater)

    他在帮助同事进行R debug时发现,同事的脚步中调用了大量的R包,而且错误主要是由于包的依赖关系没有搞好(可能某个依赖包的版本太旧或者太新),另外有很多R包已经忘记是做什么用的了,需要现场一个一个查。

    最后,他利用utils::packageDescription()对每个包都查看了一下title和version,最后整理出来,标注好了每个包的作用

    # package load ------------------------------------------------------------
    library(readr) # Read Rectangular Text Data
    library(dplyr) # A Grammar of Data Manipulation
    library(sensiPhy) # Sensitivity Analysis for Comparative Methods
    library(tibble) # Simple Data Frames
    library(weatherData) # Get Weather Data from the Web
    

    他嫌一个一个操作太麻烦,于是他写了个包,对每个R包批量进行utils::packageDescription 查看,并且一键式操作

    我们来看看这个包

    首先是安装

    # install.packages("remotes")
    remotes::install_github("luisdva/annotater")
    

    然后重启rstudio,会发现插件(Addins)这里多了这个annotater包

    最后一键式操作,点击Annotate package calls in active file

    就会看到:

    来一个动图:

    添加包的说明信息
    当然,除了能看每个包的作用(也就是它们的标题),版本可能是更为关心的

    再来一个动图:

    添加版本信息

    但这里需要说明,这个插件只能在library()后面没有注释的情况下使用;
    当添加了标题信息后,就不能继续在后面添加标题信息

    除非把之前的标题信息换行,保证library()没有注释,就可以继续添加新的版本信息【就像下面这样】

    最后再回顾一下两个常用的功能:

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