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6️⃣蛋白质序列的功能信息分析2:基于蛋白质结构域domain和

6️⃣蛋白质序列的功能信息分析2:基于蛋白质结构域domain和

作者: Y大宽 | 来源:发表于2019-02-02 09:17 被阅读33次
    [序列比对和序列特征分析总目录](https://www.jianshu.com/p/878f2b2495ae

    结构域domain比较抽象,属于蛋白质构象中二级结构和三级结构之间的一个层次,一般每个结构域有100-300个氨基酸残基组成,有特定的空间构象,并有不同的生物功能。

    InterProScan数据库:online和linux(无mac和window)

    nterPro将来自许多其他资源的蛋白质功能的预测信息统一在一起,概述了蛋白质所属的家族及其所包含的域和位点。
    非常全面,,将UniProtDB,PROTSITE,PRINTS,PFAM,ProDom等数据库中含有的蛋白质序列的结构域,motif等合并统一,包含了蛋白质所属的家族,及其所包含的结构域和功能位点。界面如下


    InterProScan

    结果如下


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