最近状态不佳，连续两件事情做的时候只想到了一半，做了又等于没做，都成了自己预想的最差的结果，要想做到最佳，只有重做，现在浪费时间结果不合适等于白做。一心多用，今天白搞一下午，越是忙碌的时候，越是出错，生活太难了。基因组分析是很个性的东西，不是流水生产线，做的越是快，问题越多，返工越多，一个项目也就是做了两次基因预测和两次HiC，要坚强！
端粒软件 （待更新）
1.FindTelomeres：https://github.com/JanaSperschneider/FindTelomeres （需要genome和gff3，可以把脚本需要gff3的部分注释掉，即可以只用genome）
2.tidk：telomeric-identifier：https://github.com/tolkit/telomeric-identifier
着丝粒软件（待更新）
1.Centromics software (https://github.com/ShuaiNIEgithub/Centromics)，需要基因组，不需要注释文件，不需要IGV
2.Telomeres_and_Centromeres： https://github.com/Immortal2333/Telomeres_and_Centromeres 这个是需要IGV结果注释文件看。
3.HiCAT： https://github.com/865699871/HiCAT #需要参考的着丝粒区域，genome。
4.quarTeT （调用tidk（telomeric-identifier），可以补gap，端粒，着丝粒）https://github.com/aaranyue/quarTeT
或者http://www.atcgn.com:8080/quarTeT/home.html
说明：各种方法的原理基本都差不多，着丝粒基本都是基于trf结果，端粒都是找重复单元，大同小异。
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