终于等到你——ggplot2树状图

作者: 天善智能 | 来源:发表于2017-12-06 13:48 被阅读44次

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    本文作者:天善智能社区专家杜雨

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    2017年8月份的R语言更新包中,默默地加入了支持ggplot2树状图的新几何对象,从此在R语言中制作树状图,不用再求助于第三方包的辅助了。

    该包既有Cran上的正式发行版,也有托管在GitHub上的开发版,安装方式如下:

    CRAN:

    install.package("treemapify")

    Github:

    devtools::install_github("wilkox/treemapify")

    GitHub主页:

    https://github.com/wilkox/treemapify

    载入本文章所需的扩展包:

    library("ggplot2")

    library("treemapify")

    library("tweenr")

    library("gganimate")

    library("RColorBrewer")

    安装该包之后,你的ggplot2中会多出一个树状图几何对象——geom_treemap()。

    本次案例使用该(treemapify)包内的内置数据集:

    预览一下数据集结构:

    str(G20)

    head(G20)

    该数据集描述20峰会参会国家的经济指标,里面包含了五个字段,分别是全球的大区(region)、国家名称(country)、GDP指标(gdp_mil_usd)(应该是二次计算的某种指标),人类发展指数(hdi),已经经济发展程度(econ_classification)。

    字段名称               类型

    region                 因子型

    country                因子型

    gdp_mil_usd        数值型(整数)

    hdi                        数值型(浮点)

    econ_classification    因子型

    树状图是没有显式坐标系统的一类特殊图形,依靠正方化算法,将样本总体正方形按照实际观测值占总体比例分割成单个矩形方块。因而其至少需要一个数值型变量作为输入参数。

    一个简单的树状图:

    ggplot(G20, aes(area = gdp_mil_usd)) +

    geom_treemap()

    因为area仅仅是定义了一个数值型变量的方块大小,填充颜色是可以单独定义的。但是颜色往往也可以单独作为一个数值型度量的表达方式。

    ggplot(G20, aes(area = gdp_mil_usd)) +

    geom_treemap(fill="steelblue")

    ggplot(G20, aes(area = gdp_mil_usd, fill = hdi)) +

    geom_treemap()+

    scale_fill_distiller(palette="Greens")

    添加标签:

    包作者针对ggplot树状图写了优化好的文本 标签函数geom_treemap_text(刚开始就说过树状图超越了传统三大坐标系的范畴,没有显式声明的坐标系统,算法比较特殊因而无法使用常规的geom_text()进行添加标签)。

    ggplot(G20, aes(area = gdp_mil_usd, fill = hdi, label = country)) +

    geom_treemap() +

    geom_treemap_text(fontface = "italic", colour = "red", place = "centre",grow = TRUE,alpha=.6)+

    scale_fill_distiller(palette="Greens")

    其中place参数控制每一个方块中标签相对于四周的位置,grow则控制标签是否与方块大小自适应(呈大致比例放大缩小)

    次级分组(亚群):

    该包支持次级分组(专业术语叫做亚群),这在实际应用场景中非常广泛,比如我们在观察国家指标大小的同时,还想获取国家所属大区的总体指标,通过加入次级分组,我们可以获取两个维度信息。通过在美学映射中设置subgroup参数(一个类别型变量),函数内部可以自动完成亚群的变量聚合计算,并在图形成用框线显示出次级类别大小的规模。

    ggplot(G20, aes(area = gdp_mil_usd, fill = hdi, label = country,subgroup = region)) +

    geom_treemap() +

    geom_treemap_subgroup_border() +

    geom_treemap_subgroup_text(place = "centre", grow = T, alpha = 0.5, colour ="black", fontface = "italic", min.size = 0) +

    geom_treemap_text(colour = "red", place = "topleft", reflow = T,alpha=.5)+

    scale_fill_distiller(palette="Greens")

    其中reflow参数用于控制标签是否自适应矩形块大小,若按照原始大小超过矩形块,则会自动换行显示。

    分面系统:

    当你觉得使用次级分组不能获得一个很好地视觉呈现效果,geom_treemap还支持ggplot函数中的fact_grid分面参数,这就是所有ggplot2扩展函数的好处,可以继承源自于ggplot2的高级图形属性。

    ggplot(G20, aes(area = gdp_mil_usd, fill = region, label = country)) +

    geom_treemap() +

    geom_treemap_text(grow = T, reflow = T, colour = "black") +

    facet_wrap( ~ econ_classification) +

    scale_fill_brewer(palette="Blues")+

    labs(

    title = "The G-20 major economies",

    caption = "The area of each country is proportional to its relative GDP within the economic group (advanced or developing)",

    fill = "Region" )+

    theme(legend.position = "bottom",

    plot.caption=element_text(hjust=0))

    GIF动画流:

    借助tweened包提供的差值方法,你可以实现将不同时间点的截面数据进行追加,并且编组成gganimate函数可识别的动画帧组,通过tweenlength、statelength和nframes 参数来控制变化的长度、每一帧停留的时间以及切换的帧数。

    G20_alt <- G20

    G20_alt$gdp_mil_usd <- sample(G20$gdp_mil_usd, nrow(G20))

    G20_alt$hdi <- sample(G20$hdi, nrow(G20))

    tweened <- tween_states(list(G20,G20_alt,G20), tweenlength = 8, statelength = 5, ease = 'cubic-in-out', nframes = 30)

    animated_plot <- ggplot(tweened, aes(area = gdp_mil_usd, fill = hdi,label = country, subgroup = region,frame = .frame)) +

    geom_treemap(fixed = T) +

    geom_treemap_subgroup_border(fixed = T) +

    geom_treemap_subgroup_text(place = "centre", grow = T, alpha = 0.5,colour = "black", fontface = "italic", min.size = 0,fixed = T) +

    geom_treemap_text(colour = "white", place = "topleft", reflow = T, fixed = T)+

    scale_fill_distiller(palette="Greens")

    ani.options(interval = 1/10)

    gganimate(animated_plot, "E:/animated_treemap.gif", title_frame = F,ani.width = 1000, ani.height = 800)

    treemapify包给ggplot2提供的geom_treemap(),填补了ggplot2原生几何对象在树状图领域的空白,可谓是进一步扩展、丰富ggplot2生态系统。

    参考文献:

    https://github.com/thomasp85/tweenr

    https://github.com/wilkox/treemapify

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    https://github.com/ljtyduyu/DataWarehouse/tree/master/File

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