光明中医函授大学理论课共28门，按照课程重要度分为必修课、考查课和自修课。其中必修课为闭卷考试，考查课为开卷考试，自修课免考。具体分类如下是：必修课（11门）：《古代汉语》（2门课，包括古代汉语基础知识和古文选读）、《诊法中药方剂口诀》、《伤寒论讲解》、《黄帝内经讲解》、《金匮要略讲解》、《温病条辨讲解》、《中医内科学》、《针灸学》、《中医妇科学》、《中医儿科学》
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考查课（7门）：《本草备要讲解》、《中医药学概论》、《中医外科学》、《中医喉科学》、《中医眼科学》、《中医骨伤科学》、《中国医学发展史概要》。
自修课（10门）：《中国哲学思想史概要》、《中医学的科学原理》、《名医医案选读》、《历代医籍选介》、《实用中医文献学》、《中西医结合临床成果》、《中医科研课题设计与探讨》、《中医临证程序与思维方法》、《现代科技》、《现代医学知识》
第一学年一、1学期1、中国医学发展史概要（36学时）
2、中国哲学思想史概要（30学时，免考）
3、古文选读（200学时）
4、古代汉语基础知识（200学时）
二、2学期5、实用中医文献学（80学时，免考）
6、中医药学概论（60学时）
7、诊法中药方剂口诀（200学时）
8、临证程序与思维方法（70学时，免考）
第二学年一、3学期1、中医学科学原理（36学时，免考）
2、黄帝内经讲解（200学时）
3、伤寒论讲解（200学时）
二、4学期4、金匮要略讲解（150学时）
5、温病条辨讲解（200学时）
6、本草备要讲解（100学时）
第三学年一、5学期1、中医内科学（300学时）
2、中医外科学（100学时）
二、6学期3、中医骨伤科学（100学时）
4、中医眼科学（100学时）
5、中医妇科学（100学时）
6、中医儿科学（100学时）
第四学年一、7学期1、针灸学（150学时）
2、中医喉科学（100学时）
3、名医医案选读（100学时，免考）
二、8学期4、现代医学知识（150学时，免考）
5、历代医籍选介（100学时，免考）
6、中西医结合临床成果（20学时，免考）
7、中医科研课题设计与探讨（20学时，免考）
8、现代科技（20学时，免考）
（学时指自学课时）
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