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单细胞拟时序分析4-PBMC单核细胞相关文章

单细胞拟时序分析4-PBMC单核细胞相关文章

作者: oceanandshore | 来源:发表于2023-10-31 23:54 被阅读0次

一、文章

1、单细胞分析揭示了急性炎症性脱髓鞘性多发性神经病中与 IL1β-IL1R2 对相关的新型克隆扩增单核细胞 - PubMed (nih.gov)

吉兰-巴利综合征的PBMC,分了7个亚群,命名了4个亚群,3个unkouwn。
CD14 + CD163 high monocytes, CD14 + CD163 low monocytes, CD14 + MALAT1 + monocytes, CD16 + monocytes, undefined 1, undefined 2, and undefined 3

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2、利用单细胞转录组学探索 H5N6 感染患者外周血单个核细胞的整体免疫景观 - PubMed (nih.gov)

禽流感病毒(AIV)和正常健康对照的PBMC。随后对先天淋巴样细胞 (ILC) 和 CD4 T 细胞的亚群分析,鉴定了10个ILC亚群。


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3、单细胞分析强调 C1q 高单核细胞对白塞病的促炎作用 - PubMed (nih.gov)

白塞病 (BD)4个实验,4个对照的PBMC。除此之外,又做了磁珠分选单核细胞 (CD14) 进行了 scRNA-seq。我们保留了 39,385 个通过严格过滤的单核细胞,包括来自 HC 的 17,321 个细胞 (44%) 和来自 BD 患者的 22,064 个细胞 (56%)。 拟时序是用Slingshot做的。


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4、乙型肝炎病毒相关慢加急性肝衰竭中与脂质代谢相关的肝内巨噬细胞重编程 - PubMed (nih.gov)**

使用来自健康对照、肝硬化患者和慢加急性肝衰竭 (ACLF)患者的肝非实质细胞(NPC)和外周血单核细胞(PBMCs)进行单细胞RNA测序。

基于外周血单核细胞和肝内单核/巨噬细胞的联合数据集进行了伪时间分析,以评估肝内单核/巨噬细胞的来源,并绘制了伪时间轨迹图(图 4e)。分化轨迹显示,Mono2 群来源于外周血单核细胞,表明它是组织单核细胞,这与其功能分析相符。单核2群进一步分化为单核1群或单核4群,单核3群(KCs)没有分化为单核1群或单核4群。这些结果表明,肝内 Mono/Mac 的增加是由于外周血单核细胞的浸润,而不是常驻巨噬细胞的增殖。

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5、外周血单细胞RNA测序显示组织蛋白酶S高表达的单核细胞加重脑缺血再灌注损伤 - PubMed (nih.gov)

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