写在前面
很多时候,我们总是有「宏图伟略」。事实上,绝大多数设想和计划都是美好的,出问题常常其实是在执行环节。换句话说,不用那么复杂的设想,也不拥有那么完美的计划,因为决定最终结果,其实在于执行。
主要内容
关于 TBtools 功能介绍,曾经我想着做两个事情:
- 一个完善的手册,经过不同人不同次数的努力,基本是失败了。究其原因,我不行,主要原因,或许是时间精力不允许。现在由两个即将进入研究生阶段的小朋友来做,目前进度良好,我想,接下来会不错。
- 一系列配套视频讲演,当然,我完全不拒绝其实我讲演一些基础知识还是比较拿手的。绝大多数听过我讲课的人,都会说不错不错云云。我会自信地认为他们说的是实话。视频讲演,相对于图文来说,更为生动,其实是更适合做湿实验的朋友,因为图文还是太干尽管信息量更大。但是呢,录制视频讲演,对讲演人的准备和临场发挥的考验更大,所以....其实真不容易。我做了一小部分,目前基本也是放弃了。不过呢,积累的一些视频讲演,还是有一些没有完全对外开放。
总的来说,我大体录制过三个视频讲演:
- 热图绘制,从原理到实践,总计5个部分,超过3个小时,目前已经完全开放。逻辑上,看到这一系列讲演,任何人做热图,几乎不会遇到困难。当然,非常复杂的热图除外,这类对于做生物学故事的朋友来说,极少会有需求。
- Fasta 序列操作,序列操作是生物数据分析常见需求,我也录制了一个2个小时的讲演,从Fasta序列格式和格式由来到最后Fasta序列操作均做了详细介绍。总的来说,如果真的有Fasta序列文件操作需要,看完这个讲演,就不会有一点问题。目前,视频在前些日子也已经完全开放于B站。
- GFF3/GTF 文件操作,涉及到序列提取和信息统计,TBtools应该是目前功能最全,且少有的 GFF3/GTF 操作工具。这类工具如果是界面化,那么没有能和 TBtools 打的。大言不惭一点,其中十几个功能,我们只要抽出其中一个功能,就可以碾压已发表的某一篇 Bioinformatics 论文。相关录频,今次开放,大体是2个半小时,看完视频,一般也不会再有使用问题了。
写在最后
最近遇上了一些有趣的事情,想了想。有时候,我们并不需要着急去做完一些工作,或者说发表一些工作。因为你一定着急,那么这个工作要做得很漂亮,其实确实很难说。这点体现在工具上或许尤为明显。
一个好的工具,只要持续打磨打磨再打磨,是否发表,发表早晚,跟工具本身是否能用,好用,是否能真正提升工作效率,其实大伙会用实际体验来投票。
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