基本流程

10×genomics平台能够一次性分离并标记500-1000个单细胞，并能在单细胞水平进行检测。具体是这样的：1、通过微流控系统，将单个细胞分子快速分配到油包水的微反应体系中，在这个体系中DNA分子会获得唯一的特异性分子标签（UMI）。在这个油包水体系里进行cDNA的扩增。2、然后细胞破碎，以cDNA为模板进行PCR扩增。3、然后制备生成的测序文库可以在illumina平台进行测序。3、然后可用cellranger等软件直接对illumina产生的数据进行分析。

10×barcode gel beads

10×标记的凝胶微珠，携带了UMI和barcode，能和单细胞结合形成GEMs。该10×genomics系统有350万种Barcoded beads，100万种UMI序列。测序后，barcode标记细胞（这就实现了单个细胞测序），UMI标记转录本并用于后续定量（避免了PCR可能带来的偏好性）。

UMI

unique Molecular Identifier，用来标记转录本

PolyT

用来捕获成熟的RNA

GEMs

包含了4部分，1是与illumina平台结合的Read1的引物，2是10×barcode（1个细胞中是一种标签），3是UMI用来标记转录本的（1个RNA片段是1种标签），4是Poly（dT）VN用来捕获成熟的RNA，跟mRNA的Poly尾结合。