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语言:Fortran 90
输入文件
一个TXT文本文件,Fortran语言风格 para.txt
参数设置
整体参数设置
分类 | 参数 |
---|---|
Overall | 群体结构, 染色体长度, 染色体数目 |
Marker | 每个染色体上的标记数, 标记的分布, 标记和QTL的突变率 |
QTL | QTL的分布, QTL的数目, QTL在多性状的分布 |
Trait | 性状的数目, 性状类型, 遗传力, 遗传相关 |
Population setting | 群体大小, 选择父本数, 选择木本书, 世代数, 选择的标准, 交配的标准, 变异率 |
输出文件主要有四类:
(1)包括家系信息、个体及其父母身份,以及每个性状和每个个体的模拟真实遗传值和表型值的数据文件;
(2)标记基因型文件,以分阶段的格式提供标记基因型;
(3)QTL基因型文件提供了真正的QTL基因型;
(4)模拟的真实QTL效应,和一个遗传参数文件的几个单独的参数文件。
分类 | 文件 |
---|---|
模拟真实遗传值和表型值的数据 | 01BV.out 02BV.out |
标记基因型文件 | 01MTYPE.out 02MTYPE.out |
模拟QTL基因型文件 | 01QTYPE.out 02QTYPE.out |
模拟的真实QTL效应 | QMAP.out MMAP.out |
模拟的真实遗传参数 | Genetic_paramenters.out |
模拟各个时期的真实遗传值和表型值的数据文件:
01BV.out
02BV.out
标记基因型文件:
01MTYPE.out
02MTYPE.out
QTL基因型文件提供了真正的QTL基因型:
01QTYPE.out
02QTYPE.out
模拟的真实QTL效应
QMAP.out
MMAP.out
模拟的真实遗传参数
Genetic_paramenters.ou
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