LPSN | 原核生物标准命名列表

作者: 胡童远 | 来源:发表于2021-06-22 15:47 被阅读0次

LPSN | 原核生物标准命名列表
生物分类
早年做基因预测需要1000元，现在只需1分钟/Prodigal原
EDGE-pro: Estimated Degree of Ge
《极简人类史》之五——生命的起源
Phylophlan（三）将新物种插入进化树
基因的转录调控
【陪你学·生信】三、核苷酸序列数据库的使用（2）
生命的进化与演进
生物进化论与互联网商业变革

LPSN全称List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature。源自1997，近期更新发表文章于2020。该数据库包含各细菌type strain信息，直接提供16S rDNA fasta序列。

官网：https://www.bacterio.net/

近期文章
标题：List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) moves to the DSMZ.
杂志：International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology
时间：2020

主页

拥有完整的分类注释信息

提供type strain链接，16S序列可直接下载

LPSN | 原核生物标准命名列表
LPSN全称List of Prokaryotic names with Standing in Nomencla...
生物分类
1925：原核生物、真核生物1969：原核生物、植物、动物、真菌、原生生物（五界分类系统）1990: 真细菌域...
早年做基因预测需要1000元，现在只需1分钟/Prodigal原
原核生物基因的特点： -许多原核生物mRNA以多顺反子的形式存在-原核生物mRNA无帽子结构，也没有或只有较短的多...
EDGE-pro: Estimated Degree of Ge
introduction 转录组定量工具已经有很多了，为什么要专门做一个针对原核生物的工具？真核生物与原核生物的基...
《极简人类史》之五——生命的起源
38亿年前，地球上第一次出现了生命——原核生物，原核生物是地球上结构最简单的生命，但原核生物的存在度很高清，即使现...
Phylophlan（三）将新物种插入进化树
导读 Prodigal是原核生物基因预测软件，常被用于原核生物de novo组装分析中。Prodigal能预测由d...
基因的转录调控
原核生物与真核生物基因表达方式的主要区别原核生物：基因的转录与mRNA的翻译偶联，转录与翻译同步进行，不存在mR...
【陪你学·生信】三、核苷酸序列数据库的使用（2）
二、使用GenBank 1. 针对原核生物基因的GenBank使用介绍原核生物基因组相对小，而且DNA序列，mR...
生命的进化与演进
地球上的生命，从最原始的无细胞结构状态进化为有细胞结构的原核生物，从原核生物进化为真核单细胞生物，然后按照不同方向...
生物进化论与互联网商业变革
我们都知道地球上的生命，从最原始的无细胞结构状态进化为有细胞结构的原核生物，从原核生物进化为真核单细胞生物，然后按...