数据分析处理的过程中,绝大部分的科研工作者,都会存在利用数据绘制热图的需求。如果你会编程,利用R、MATLAB 等,完成热图的绘制轻轻松松没烦恼,其次你还可以利用热图绘制软件完成目标,但是你知道怎么利用Excel画热图吗?
众所周知,Excel是一款强大的电子表格软件。直观的界面、出色的计算功能和图表工具,再加上成功的市场营销,使Excel成为最流行的个人计算机数据处理软件。而接下来小编将教你利用Excel来画热图!
软件
Excel
Acrobat Professional(在Excel中加载其PDFMaker加载项,确保Adobe PDF选项出现在另存为选项中)
绘图过程
数据的格式没有太多要求,如果需要换算,可以先行完成。下图为本次演示的数据格式:
1、基本设置
选中需要绘制热图的数据区域,进入工具栏开始——条件格式——色阶——其他规则,进入条件格式的设置,包括规则类型,格式类型,以及最大值最小值类型和颜色设置等,如下两图显示过程:
例如,基于案例数据,选中格式类型:双色阶,设置最小值对应白色,最大值最对应红色,可以获得如下结果:
2、样式调整
基于前一步的结果进行调整,例如隐藏所有的数字,需要注意数字和颜色为对于关系,不能直接删除。操作过程为:选中数据区域——右键单击——选择设置单元格格式——数字(自定义)——修改类型,在半角状态下输入三个分号,点击确定,隐藏数字。操作经过如下图(A),其结果如下图(B)。同时,也可以通过设置单元格格式,选中边框设置,显示出热图边框,其结果如下图(C)。
当然,还可以修改热图单元格的长宽,如下图所示,选中修改区域后,在开始菜单中,选中格式,可以进行行高和列宽设置。
3、其他格式与图例
除了以上设置修改外,还可以在条件格式中,选择其他的格式类型(如下图A),例如三色阶或者图标集等,修改热图具体的呈现效果,其效果如下图B、C:
在完成图例绘制之后,需要获取热图图例,可以在条件格式设置过程中,对生成的色条进行截图而获得,如下图三色阶对应的色条截取,截取之后粘贴在适当的区域。
4、文件保存
完成图片设置之后,选定需要保存的热图完整区域,另存为PDF格式文件。选中保存区域——文件另存为——Adobe PDF,弹出Acrobat PDFMaker——选定的内容——点击转换为PDF,会跳转出保存窗口——单击选项——选中适合纸张宽度(除默认设置外),即可保存为PDF文件(如下图)。
注意:选中另存为Adobe PDF,是因为该方法可以调整图片的宽度和纸张适应(非长度)。而直接另存PDF,图片的宽度可能大于纸张宽度,易造成图片不完整。
结语
虽然相较于专业的热图绘制软件或者编程方法,Excel并不具备绘制聚类热图的功能,在实用性方面有一定缺陷。但是利用Excel绘制热图,相对于其他方法而言,简单快速,值得一学。
更多生物信息课程:
1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读
2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读
3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,提升你的文章档次,学习链接:WGCNA-加权基因共表达网络分析
4. 转录组数据怎么挖掘?学习链接:转录组标准分析后的数据挖掘、转录组文献解读
5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读、OTU网络图绘制、cytoscape与网络图绘制课程
6. 生物信息入门到精通必修基础课,学习链接:linux系统使用、perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图
7. 医学相关数据挖掘课程,不用做实验也能发文章,学习链接:TCGA-差异基因分析、GEO芯片数据挖掘、GSEA富集分析课程、TCGA临床数据生存分析、TCGA-转录因子分析、TCGA-ceRNA调控网络分析
8.其他课程链接:二代测序转录组数据自主分析、NCBI数据上传、二代测序数据解读。
网友评论