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DiffBind 2.10版本安装

DiffBind 2.10版本安装

作者: 余绕 | 来源:发表于2023-04-17 18:03 被阅读0次

1. 首先选择R 3.5.1(July)版本 ,该版本对应的是DiffBind2.10

下载网站:Index of /bin/windows/base/old/3.5.1 (r-project.org)

https://cran.r-project.org/bin/windows/base/old/3.5.1/
image.png

2. 安装Rools,下载对应R版本的Rtools,并安装上。

image.png

3.安装amap,

image.png
3.1下载手动安装
image.png

4. 安装diffbind

options(BioC_mirror="https://bioconductor.org")
BiocManager::install("DiffBind") #默认安装2.10

5. 安装各种缺失包, 每安装一个,根据提示安装下一个。type = "binary"参数很牛逼,很多默认装不上的都可以安装上!!!安装不上包的要考虑BiocManager::install()

install.packages("caTools", type = "binary")
install.packages("gplots")
install.packages("locfit",type = "binary")
install.packages("rjson",type = "binary")
install.packages("latticeExtra",type = "binary")
install.packages("colorspace",type = "binary")
install.packages("utf8",type = "binary")
BiocManager::install("GO.db") #install.packages() 安装不上的要考虑BiocManager::install
install.packages("BatchJobs")

最后安装OK!

installed.packages()["DiffBind","Version"]
[1] "2.10.0"
image.png

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