NCBI下载数据的提取

作者: chaimol | 来源:发表于2019-03-22 20:02 被阅读5次

NCBI下载玉米基因组的各种数据。
下载地址：
ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/refseq/plant/Zea_mays/latest_assembly_versions/
这是最新的版本。对于其他的物种，只需要更改后缀即可。
或者是直接在https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
选择genome,之后输入物种的拉丁名，之后按照图示选择，即可进入ftp下载地址。

image.png

readme文件会详细介绍目录结构，文件结构。
本次的重点是实现基因编号和GID变好的互相转换。
下载*_feature_table.txt.gz文件，提取基因信息和GID编号。

NCBI下载数据的提取
NCBI下载玉米基因组的各种数据。下载地址：ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/...
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