DiscoVista安装

作者: 小黑采蘑菇 | 来源:发表于2024-04-08 15:51 被阅读0次

    DiscoVista是一个可视化多物种树的软件,由python2编写;大家在安装的时候可以单独构建一个python2的环境。

    下载安装包

    git clone https://github.com/esayyari/DiscoVista
    

    安装r-base

    mamba install r-base
    # 配置程辑包 
    find . -name *R*
    cd /public/home/Wanggs/mambaforge-pypy3/bin
    R
    install.packages(c("Reshape","Reshape2","ggplot2","plyr","scales","ape","optparse"))
    

    配置python2

    wget https://bootstrap.pypa.io/pip/2.7/get-pip.py
    python2 get-pip.py
    pip2 install dendropy
    

    由于DiscoVista是由python脚本直接运行的,所以我们可以进入其文件夹

    cd /public/home/Wanggs/software/DiscoVista/src/utils
    python2 discoVista.py -h
    

    成功!
    软件网址:esayyari/DiscoVista (github.com)

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