这个是我在听报告时听到的，对这个比较感兴趣，这里作为学习笔记

关于iso-seq

首先介绍下iso-seq，这是基于PacBio的单分子实时测序，隶属于三代测序，其特点是超长的读长，故在建库中无需打断RNA链，保证了RNA的完整性，即有完整的5'端到3'端的RNA链，所以具有超高的准确率，在鉴定转录本，fusion gene，可变剪切的事件中发挥了比较准确的效果（wiki百科）

通常来说，iso-seq的建库方式是通过拉取poly A尾巴的全长转录本，然后反转成cDNA，然后进行cDNA修复。在测序时，测序长度分为CLR模式和CCS模式

参考：https://github.com/PacificBiosciences/IsoSeq

IsoSeq 数据聚类程序 SMRTLink
https://github.com/PacificBiosciences/IsoSeq_SA3nUP/wiki

长序列比对软件 minimap2
https://github.com/lh3/minimap2

全长转录组去冗余程序 Cupcake
https://github.com/Magdoll/cDNA_Cupcake

当然最美不过官网：
https://www.pacb.com/products-and-services/analytical-software/rna-sequencing/
以及workflow：https://www.pacb.com/support/software-downloads/