安装
conda create -n genomad
conda activate genomad
conda install genomad -c conda-forge -c bioconda genomad
# 数据库
genomad download-database .
[14:30:45] Requesting
https://portal.nersc.gov/genomad/__data__/genomad_db_v1.6.tar.gz.
[15:11:30] Finished downloading genomad_db_v1.6.tar.gz.
[15:11:45] Database extracted to genomad_db.
[15:11:45] Deleted genomad_db_v1.6.tar.gz.
[15:11:45] geNomad database (v1.6) is ready to be used!
按照实验需求，质粒构建分为克隆质粒，表达质粒，基因敲除质粒，报告质粒，病毒质粒，基因组工程质粒等。 这部...
标题：PlasFlow: predicting plasmid sequences in metagenomic ...
质粒扩增是指我们测序结果阳性质粒，后要后续包装病毒或者感染细胞，而需要量很大时，将现在阳性结果的质粒扩增。感受态：...
构建 lncRNA 过表达质粒或者慢病毒、腺病毒包装载体。原则上是将全长lncRNA 定向克隆到表达载体上实现 l...
随着分子生物学和细胞生物学研究的不断发展，转染已经成为研究和控制真核细胞基因功能的常规工具。在研究基因功能、调控基...
质粒解剖 质粒四大要素： 一、复制起点：控制着质粒的复制，并决定了质粒的宿主和拷贝数； Ori 是质粒的复制起点（...
用于生产慢病毒质粒的菌株：由于慢病毒存在较长的末端重复序列，为了减少不稳定区域的同源重组频率，一般使用：NEB稳定...
质粒提取原理 从细菌中分离质粒DNA的方法包括三个基本步骤：培养细菌使质粒扩增，收集和裂解细胞，分离和纯化质粒DN...
今天要记录一个很实用的实验技巧：如题，怎么利用低浓度的质粒包好慢病毒吗？ 慢病毒已经成为目前生命科学领域一个很常用...
细菌质粒相比较于细菌染色体基因非常容易发生水平转移，质粒可从环境中获得质粒或丢失掉。质粒的存在往往有利于细菌的生存...
本文标题：genomad预测质粒、病毒
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/qevbidtx.html
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