PlasFlow预测质粒

作者: 胡童远 | 来源:发表于2021-10-28 17:00 被阅读0次

    标题:PlasFlow: predicting plasmid sequences in metagenomic data using genome signatures
    杂志:Nucleic acids research
    时间:2018
    单位:波兰科学院
    被引:170(2021.10)

    Plasflow相比cBar预测效果更好


    预测质粒工具
    cBar:https://cge.cbs.dtu.dk/services/PlasmidFinder/
    PlasmidFinder:https://cge.cbs.dtu.dk/services/PlasmidFinder/
    Recycler:https://github.com/Shamir-Lab/Recycler

    PlasFlow GitHub: https://github.com/smaegol/PlasFlow

    安装

    conda install plasflow
    

    更多:
    从宏基因组数据挖掘生境中隐藏的DNA暗物质——质粒

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