Sentieon软件严格忠于GATK/BWA行业金标准,在保持结果一致的情况下,保持计算速度提升10倍以上。如果课题组有大的群组或者大基因组,可以尝试着去用一下。为了便于查找对应模块,将Sentieon最新版的模块列表贴在下面,同时给出与GATK/BWA模块的对应表。可以方便在自己pipeline中进行添加替换,十分方便。
Sentieon全模块列表
Sentieon与GATK模块对照表
Sentieon软件严格忠于GATK/BWA行业金标准,在保持结果一致的情况下,保持计算速度提升10倍以上。如果课题组有大的群组或者大基因组,可以尝试着去用一下。为了便于查找对应模块,将Sentieon最新版的模块列表贴在下面,同时给出与GATK/BWA模块的对应表。可以方便在自己pipeline中进行添加替换,十分方便。
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Sentieon与GATK模块对照表
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