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Sentieon软件发布202112.02版本更新

Sentieon软件发布202112.02版本更新

作者: chSNP | 来源:发表于2022-04-03 10:52 被阅读0次

    Sentieon 软件忠于BWA、GATK、MuTect、MuTect2、STAR、Minimap2等金标准的数学模型,在保证完全匹配开源分析方案结果的前提下,计算效率提升15倍以上。Sentieon为大群组项目提供一站式Joint Calling解决方案,可同时处理10万个WGS样本的Joint Calling,无需中间步骤。大幅提升WGS/WES/Panel/ctDNA/RNA等基因数据NGS分析效率和计算精度。


    Sentieon Release

    根据用户的需求与反馈,持续迭代改进Sentieon软件包。2022年4月2日,Sentieon推出了最新的202112.02版本:

    • 升级了DNAscope的机器学习模型模块;

    • 进一步提升了Sentieon BWA在某些ARM架构CPU平台上的计算效率;

    • 添加了对多个测序平台的许可框架支持;

    除此之外,Sentieon 202112.02版本软件,还对前一个版本的bug进行了修复。

    新添加功能

    • A license framework to support multiple sequencing platforms.
    • Improved bwa-mem speed on certain ARM CPU.

    新添加功能

    • Solved issue in GVCFtyper that would produce no-calls in certain ploidies when input is a multi-sample merged gVCF from third party tool.
    • Solved issue in DNAscope that could produce no call at zero coverage site when using --given.
    • Solved issue that triggered CRAM buffer overflow when minimap2 output zero-length secondary reads
    • Solved issue in minimap2 that would cause the job to hang under rare circumstances.

    Sentieon 新版手册及安装包下载链接
    Sentieon 中文介绍

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