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Linux: 如何使用samtools看你的 PE librar

Linux: 如何使用samtools看你的 PE librar

作者: Ternq8 | 来源:发表于2017-08-25 21:21 被阅读34次
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ATAC-seq 的insert size 怎么搞,来干的,直接套底下的。

samtools view P12.oLT.R1.trim.PE2SE.nodup.bam | awk '$9>0' | cut -f 9 | sort | uniq -c | sort -b -k2,2n | sed -e 's/^[ \t]*//' > ./size_density/p12.oLT.sd.txt

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