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比对结果统计:featureCounts安装

比对结果统计:featureCounts安装

作者: 笺牒九州的怪咖 | 来源:发表于2022-03-12 14:29 被阅读0次

下载软件

wget https://nchc.dl.sourceforge.net/project/subread/subread-2.0.3/subread-2.0.3-Linux-x86_64.tar.gz
#-rw-rw-r--. 1 XXX XXX 50141646 7月  15 2021 subread-2.0.3-Linux-x86_64.tar.gz

二进制版本的软件解压就可使用

tar zxvf subread-1.5.3-Linux-x86_64.tar.gz

解压后进入文件夹的bin

cd subread-2.0.2-Linux-x86_64/bin/
ls 
#exactSNP  featureCounts  subindel  subjunc  sublong  subread-align  subread-buildindex  utilities

运行这个软件就是带上全部路径

/public/XXX/biosoft/subread-2.0.2-Linux-x86_64/bin/featureCounts 

运行后出现了帮助文档,就是代表安装成功可以使用

写入环境,直接调用

vi ~/.bashrc
export PATH=/public/XXX/biosoft/subread-2.0.2-Linux-x86_64/bin/:$PATH
source ~/.bashrc
featureCounts -h   #出现帮助文档即安装完成

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