les snpeff.vcf |awk -F"\t|\\\\|" '{printf ("%s\t%s\t%s\n", $1,$2,$9)}' | cat
snpeff可以用于snp 和indel 文件的拆分,也可以用于注释这俩文件。 conda下载snpeff con...
SnpEff使用方法 SnpEff 软件通过基因组结构注释数据(GTF文件),对VCF文件中的SNP/InDel信...
SnpEff结果文件的解读 根据上一篇简书中SnpEff结果产生的4个文件进行解读 第一个文件:positive....
需求 使用snpEff软件对vcf格式文件进行注释后会生成一个snpEff_summary.html;这个文件是对...
按照文件大小切割 按照行数切割 指定切割后的文件前缀
这算是笔记。。。。 前提是总vcf文件已经用snpeff注释过了
1、文件切割1、指定切割文件的大小 2、指定切割文件的文字行数 参数介绍: 下面是切割脚本 下面是 定期删除脚本 ...
文件切割: 使用Properties配置文件\ 切割与配置文件:
snpEff是一个非常好用的变异注释软件,具体使用流程如下: 安装下载安装包 解压 解压得到snpEff文件夹 配...
上一期,给大家介绍了SnpEff注释数据库。这一期着重介绍SnpEff的命令,最后一期介绍注释结果解析 准备文件已...
本文标题:2023-05-10 | 对于snpeff文件的切割
本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/qvorsdtx.html
网友评论