学习徐州更老师的《生信必修课之软件安装》笔记 https://ke.qq.com/course/310838。
此次安装的有：sratoolkit, hisat, 和NCBI blast
习惯将安装包放在~/src 下，将解压缩的内容放在~/op/biosoft
因此，新建biosoft文件夹
mkdir -p ~/opt/biosoft
mkdir -p ~/opt/sysoft
在百度上搜索sratools download
https://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sdk/2.9.2/sratoolkit.2.9.2-centos_linux64.tar.gz
wget -c https://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sdk/2.9.2/sratoolkit.2.9.2-centos_linux64.tar.gz
-c表示断点续传
下载完成后，解压缩
tar -zxvf sratoolkit.2.9.2-centos_linux64.tar.gz
将解压缩的内容移动到src文件夹下面
mv -i sratoolkit.2.9.2-centos_linux64 ~/opt/biosoft/
同理，下载HISAT2
wget -c ftp://ftp.ccb.jhu.edu/pub/infphilo/hisat2/downloads/hisat2-2.1.0-OSX_x86_64.zip
解压缩，但这回是zip结尾，所以
unzip hisat2-2.1.0-OSX_x86_64.zip
mv hisat2-2.1.0-OSX_x86_64.zip ~/opt/biosoft
下载NCBI-blast
wget -c ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/
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